上海大学理学院化学系基础有机实验室位于化学实验楼5楼，拥有3间大型标准实验室。每间基础有机实验室面积为120m2，配有4人通风操作台8组，可容纳128位学生的实验用品；另外每间实验室配备1组一体式通风实验操作台，5台循环水式多用真空泵，2套旋转蒸发装置，2个电热鼓风干燥箱，2台百分位电子天平，2组大型药品放置柜，2组学生用储物柜，多媒体教学设备，防护眼镜，急救箱等。
另外，基础有机实验室配有一间面积为42 m2的仪器室，放置实验中使用的仪器设备，如：1台Ls-55荧光仪、2台T6新世纪紫外仪、2台NOVA-II微波合成仪、2台M-565全自动熔点仪、1台MS105DU精细天平、6台WYA-2W阿贝折光仪以及2台WFH-203B三用紫外分析仪等。在传统基础教学中引入这些现代化的仪器，大大拓宽了学生的视野，提高了学生的学习效率和兴趣。
